home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00764 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.0 KB  |  29 lines
  1. ************************************
  2. * Ribosomal protein S21e signature *
  3. ************************************
  4.  
  5. A number of eukaryotic  and  archaebacterial ribosomal proteins can be grouped
  6. on the basis of sequence similarities. One of these families consists of:
  7.  
  8.  - Mammalian S21 [1].
  9.  - Rice S21 [2].
  10.  - Yeast S21 (Ys25) [3].
  11.  - Schizosaccharomyces pombe S28 [4].
  12.  
  13. These proteins  have 82 to 87 amino acids. As a signature pattern, we selected
  14. a perfectly conserved nonapeptide in the N-terminal part of these proteins.
  15.  
  16. -Consensus pattern: L-Y-V-P-R-K-C-S-A
  17. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  19. -Last update: June 1994 / First entry.
  20.  
  21. [ 1] Bhat K.S., Morrison S.G.
  22.      Nucleic Acids Res. 21:2939-2939(1993).
  23. [ 2] Nishi R., Hashimoto H., Uchimiya H., Kato A.
  24.      Biochim. Biophys. Acta 1216:113-114(1993).
  25. [ 3] Suzuki K., Otaka E.
  26.      Nucleic Acids Res. 16:6223-6223(1988).
  27. [ 4] Itoh T., Okata E., Matsui K.A.
  28.      Biochemistry 24:7418-7423(1985).
  29.